분명히 교회는 과학의 업적과 몫을 인정한다. 교황 요한 바오로 2세는 회칙 ‘신앙과 이성’ 끄트머리에서 “인류가 오늘날의 발전을 크게 빚지고 있는 과학적 탐구의 이 용감한 선구자들에 대한 저의 경탄을 표현하고 격려”하면서 과학이 이룩해온 성취에 대해 거듭 놀라움을 표시한다. 교황의 이같은 경탄과 격려는 곧 “신앙과 진정한 과학 사이에는 어떠한 갈등도 있을 수 없으며, 비록 서로의 길이 달라도 모두 진리를 추구해왔다고 늘 당당히 밝혀” 온 교회의 입장을 그대로 드러낸다.

바로 이 때문에 교회는 오늘날 과학과 기술의 영역에서 새로운 복음화가 절실히 요구되는 상황에 대해 참으로 안타까운 심정을 표시하고 있다. 특별히 교회는 신앙의 해를 맞아 진정한 과학의 정신에서 벗어난, ‘합리적 확실성이 과학적·기술적 발견에 한정된 것으로 여기는’ 오늘날의 과학주의적 사고방식에 대해 깊이 우려하고 이에 대한 사목적 대처 방안을 마련할 것을 보편교회와 주교회의, 그리고 각 교구에 요청하고 있다.

교황청이 신앙의 해를 맞아 발표한 사목적 권고를 담은 공지문은 그 구체적인 방안으로 신앙의 해 기간 동안 각종 ‘호교론적인’ 책자와 리플렛을 제작할 뿐만 아니라, 학계와 문화계에서 심포지엄과 토론회, 세미나 등을 통해, 특별히 가톨릭 대학들에서 신앙과 이성의 창조적 대화를 새롭게 하는 기회를 마련할 것을 촉구하고 있다.

편협한 과학주의의 폐해에서 벗어나기 위해서는 무엇보다도 신앙과 이성의 지속적인 대화를 위한 신학화의 작업이 절실하게 요구된다. 이미 세속화된 세계 안에서 생활하고 있으며, 신앙적인 사고를 위협하는 온갖 문화적 경향들 안에서 생활하는 일반 신자들은 ‘과학주의’의 위험성에 상시적으로 노출되어 있다고 할 수 있다.

과거에 종교가 하던 역할을 이제는 과학과 기술의 성취가 담당하게 된 오늘날의 사회에서 교회는 더 이상 일반 신자들의 느슨한 신앙 태도, 과학과 신앙의 관계에 대한 오해를 비난하기만 해서는 안될 것이다. 오히려 교회의 신학자들이 과학주의적 사고방식과 그 위험성에 대해서 경각심과 관심을 갖고 탐구, 이에 대한 신학적 성찰을 통해서 교회와 신자들에게 올바른 방향을 제시해주어야 할 필요가 있다.

여기에서 교회는 신자 과학자들의 몫에 대해서 각별한 관심과 사목적 배려를 염두에 두어야 할 것으로 보인다. 이미 자신이 헌신하는 과학적 연구와 신앙의 가교를 건설하고 있는 이들 신자 과학자들이 신앙과 이성, 과학과 종교의 관계에 대해 지니고 있는 지혜와 믿음은 오늘날 교회 안의 신자들이 과학주의에 매몰되거나 치우치기 쉬운 위험성에 대한 해독약이 될 것이기 때문이다.